Ejemplo, para configurar los costes de envío en el transportista envios a España-Península y España-Nopenínsula, con precios distintos:

Creamos las 2 zonas, España-Península y España-Nopenínsula

Elegimos la zona y configuramos los precios de envio.

Deshabilitar los paises en los que no se vaya a enviar, es tedioso, pero conviene hacerlo. Tan sólo dejas España y seleccionar SI (Activado)

Para que no salga transportista gratis hay que configurar el precio dentro del transportista.

Para que  a partir de tal cantidad por ejemplo sean los portes gratis, habría que crear el mismo transportista pero con portes gratis y elegir las condiciones oportunas de cantidad requerida para que sea gratis dicho porte.

Fuente: Promocionalia/Prestashop forums